Les fonds d’investissement à but non lucratif ciblent les plus petites IMF qui connaissent aussi un taux de croissance plus faible que les IMF leader financées par les fonds d’investissement obligataires et les fonds de placement enregistrés. Ces fonds se distinguent également par leur répartition géographique et desservent d’autres régions ainsi que des zones rurales. Cette catégorie de fonds privilégie la dimension sociale et favorise autant le rendement financier que l’impact social. Selon le CGAP, le rendement moyen de ce type de VIM est de 1.5%1. En Suisse, on peut citer le Fonds International de Garantie (FIG) une coopérative à but non lucratif émettant des garanties en faveur des banques locales. ECLOF, organisation à but non lucratif d’inspiration chrétienne, octroie des prêts par le biais de son réseau d'IMF affiliées. Aga Khan Agency for Microfinance, a créée son propre réseau d’IMF et le soutient par le biais de prêts et de participations au capital social. Chaque VIM a ses propres régions de couverture géographique. Le montant moyen de leur transaction est certes beaucoup plus petit et requiert des évaluations d’IMF rigoureuses, ce qui engendrent des frais de gestion plus élevés.
1 Le Consultative Group to Assist the Poor (CGAP) Focus Note N° 44: Foreign Capital Investment in Microfinance